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연구정보

연구자현황

김상태(Sang-Tae Kim) 프로필 이미지 학과장

김상태 부교수

Sang-Tae Kim

연구분야

생명과학, 진화유전체학, 유전체교정

연구키워드

식물 진화 유전체학 유전체교정 진화 유전학

교수소개


						
김상태 교수는 서울대학교 생물학과를 졸업하고, 숲과 들을 지키는 식물의 변이와 분류에 관심이 있어 동 대학에서 식물분류학으로 석사학위를 취득하고, 미국 예일대학교로 유학하여 식물 분류군의 진화 계통 및 배수화가 종분화 및 종 다양성에 미치는 역할을 연구하여 박사학위를 취득하였다. 이후 독일의 막스플랑크 연구소에서 박사후 연구원으로 차세대 염기서열 기법을 통한 유전체학 연구 및 식물 종들의 자연 변이를 통한 적응과 진화를 연구하였다. 그리고 국내로 복귀하여 기초과학연구원 유전체교정 연구단에서 연구위원으로, 인간과 동물, 식물을 포함하는 다양한 생물체에서 크리스퍼를 이용한 유전체 교정 연구를 새롭게 경험하고, 2020년 가톨릭대학교로 임용되어 현재는 ‘식물 진화 및 유전체학’ 연구실을 마련하여 다양한 생물종의 전장유전체-유전자형을 생산하고 집단유전학적 연구를 통해 생물 집단의 유전 다양성 및 진화적 역사를 탐구하고 있으며, 크리스퍼 매개 유전체 교정 기법을 이용하여 자연 변이 유래 적응 형질을 연구하고 이들 형질의 기능적 역할과 미래 쓰임새에 관해 연구하고 있다. 다양한 변이와 다름이 있는 생태계의 생물들이 어떻게 조화를 이루어 평형을 이루고 있을까? 자연계의 변이와 평형에 대한 이해, 더 나아가 지구의 미래 지속성과 인간의 더 나은 삶을 만들 수 있는 여러 주제를 함께 공부하고 교육하고 토론하고자 한다.
What makes nature stable even with such unpredictable variations? This question has led my scientific career and will be the main motivation for my future teaching and research.  My road to understanding natural variation and the ecological coexistence of diverse living things has been initially filled with plant systematics and phylogenetics for my doctoral research on the diversification and the role of hybrid speciation at Yale University.  My post-doctoral research at the Max-Planck Institute in Tuebingen, Germany has broadened my road with a new insight into evolutionary genomics.  I performed a large-scale survey of local field populations using modern genomics technology. I dealt with big sequencing data using my bioinformatics skills to look for a signature of selection and evolutionary footprints relating to local adaptation in model plants and relatives. I continued to broaden my research area with genome editing techniques (the CRISPR/Cas9 system) and led the bioinformatics group at the Institute for Basic Science. I started my lab (Plant Evolution and Genomics Lab: PEGL) at the Catholic University of Korea in 2020. I have actively extended our understanding of trait evolution and local adaptation with CRISPR systems in plants, which can develop new traits for crop improvement. My lab is also working on population genetic studies of various plant populations. 

최종학력

2008.05.26 | 예일대학교 | 생태 및 진화 생물학 | 이학박사 (Ph. D.)

연구실적

  • 2024.04 | 공동저자 | SCIENTIA HORTICULTURAE, 제330권
    CRISPR/Cas9-edited SPL-CNR quantitatively control tomato fruit ripening
  • 2023.06 | 교신저자 | KOREAN JOURNAL OF PLANT TAXONOMY, 제53권 2호, pp.148-156
    A survey of the genome-wide genetic variation of Hibiscus hamabo (Malvaceae)
  • 2023.03 | 공동저자 | FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 제14권
    High-quality genome assembly and genetic mapping reveal a gene regulating flesh color in watermelon (Citrullus lanatus)
  • 2022.12 | 공동저자 | NATURE COMMUNICATIONS, 제13권 1호
    Genotyping-by-sequencing-based identification of Arabidopsis pattern recognition receptor RLP32 recognizing proteobacterial translation initiation factor IF1
  • 2022.10 | 공동저자 | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 제23권 20호
    Comprehensive Genome-Wide Analysis and Expression Pattern Profiling of the SlHVA22 Gene Family Unravels Their Likely Involvement in the Abiotic Stress Adaptation of Tomato
  • 2022.06 | 교신저자 | Mitochondrial Dna Part B-resources, 제7권 6호, pp.1143-1145
    The complete chloroplast genome of Utricularia tenuicaulis Miki (Lentibulariaceae) isolated in Korea
  • 2022.03 | 교신저자 | Mitochondrial Dna Part B-resources, 제7권 3호, pp.541-543
    The complete chloroplast genome of Atriplex gmelinii C. A. Mey. ex Bong. (Amaranthaceae)
  • 2022.01 | 공동저자 | PLANT JOURNAL, 제109권 1호, pp.144-163
    Oxidative stress response and programmed cell death guided by NAC013 modulate pithiness in radish taproots
  • 2021.12 | 제1저자 | KOREAN JOURNAL OF PLANT TAXONOMY, 제51권 4호, pp.345-352
    The complete chloroplast genome of Diarthron linifolium (Thymelaeaceae), a species found on a limestone outcrop in eastern Asia
  • 2021.11 | 교신저자 | DIVERSITY, 제13권 11호
    A cryptic invader of the genus persicaria (Polygonaceae) in la palma and gran canaria (Spain, Canary Islands)
  • 2021.11 | 교신저자 | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 제22권 21호
    The functional association of acqos/victr with salt stress resistance in arabidopsis thaliana was confirmed by crispr-mediated mutagenesis
  • 2021.06 | 공동저자 | STEM CELL REVIEWS AND REPORTS, 제17권 3호, pp.1053-1067
    Off-the-Shelf, Immune-Compatible Human Embryonic Stem Cells Generated Via CRISPR-Mediated Genome Editing
  • 2021.04 | 교신저자 | SCIENTIFIC REPORTS, 제11권 1호
    The efficacy of CRISPR-mediated cytosine base editing with the RPS5a promoter in Arabidopsis thaliana
  • 2021.02 | 공동저자 | NEW PHYTOLOGIST, 제229권 3호, pp.1215-1233
    Genetics of autoimmunity in plants: an evolutionary genetics perspective
  • 2021.01 | 공동저자 | GENES, 제12권 1호, pp.1-24
    Genome-wide identification and expression profiling of the pdi gene family reveals their probable involvement in abiotic stress tolerance in tomato (Solanum lycopersicum l.)
  • 2021.01 | 공동저자 | NATURE COMMUNICATIONS, 제12권 1호
    The patterns of deleterious mutations during the domestication of soybean
  • 2019.10 | 공동저자 | Plant Biotechnology Reports, 제13권 5호, pp.533-541
    Guidelines for C to T base editing in plants: base-editing window, guide RNA length, and efficient promoter
  • 2019.10 | 제1저자 | Plant Biotechnology Reports, 제13권 5호, pp.543-551
    A zero-background CRISPR binary vector system for construction of sgRNA libraries in plant functional genomics applications
  • 2019.07 | 공동저자 | PLOS GENETICS, 제15권 7호
    RPW8/HR repeats control NLR activation in Arabidopsis thaliana
  • 2018.12 | 공동저자 | BMC BIOINFORMATICS, 제19권
    Web-based design and analysis tools for CRISPR base editing